Bilgi İşlem Departmanı, Antakya Fen Bilimleri Koleji Anadolu Lisesi'nde bilişim teknolojilerinin etkin ve güvenli bir şekilde kullanılmasını sağlayan bir birimdir. Bu departman, okulun bilgisayar ağlarını yönetir, öğrenci bilgi sistemlerini sürdürür ve günceller. Ayrıca, öğretmen ve öğrencilere teknik destek sağlar, bilgisayar ve yazılım sorunlarıyla ilgilenir ve çözümler üretir. Bilgi İşlem Departmanı, eğitim teknolojilerinin entegrasyonunu yöneterek öğretim süreçlerini destekler ve okulun dijital altyapısını güncel tutar. Ayrıca, bilgi güvenliği ve veri yönetimi konularında önlemler alarak okulun bilişim sistemlerini korur ve sürdürülebilir bir teknoloji altyapısını sağlar.